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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

看演出、赶大集、写春联、绘年画 荆楚各地百场“村晚”迎新春******

　　楚天都市报极目新闻讯（记者郑力强通讯员鄂文旅）1月8日，湖北省孝感市孝昌县王店镇磨山村歌声嘹亮、年味十足，老老少少看演出、赶大集、写春联、绘年画。这是“启航新征程幸福中国年”——2023年全国“村晚”示范展示活动的湖北孝昌分会场。

　　湖北共有三场特色“村晚”入选全国小年接力展播活动，孝昌是第一站。接下来还有宜都市陆城街道太保湖村、来凤县百福司镇的“村晚”活动会在国家公共文化云和央视频小年接力直播中亮相。

　　孝昌“村晚”作为打头阵的示范展演，年味浓、内容新、接地气。精彩节目展演的同时，观众还被现场的“年会大集”吸引，丰盛年货、地方特产、非遗文创、精美礼品等应有尽有。

　　元旦春节前后，全省各市州文化和旅游局，积极引导和支持具备条件的乡村，通过线上线下等形式，举办特色“村晚”，通过办好3场全国接力展播活动、N场示范活动，以及100场县级“村晚”活动，打造2023年“3+N+100”湖北“村晚”活动矩阵。以线上线下相结合的形式开展戏曲进乡村、新春赶大集、社火庙会、灯谜歌会、游艺联欢、舞龙舞狮等各类节庆文化惠民活动，生动呈现乡村振兴的丰硕成果，带动乡村旅游，使“村晚”成为人民群众积极参与、共同缔造的新年俗。

　　“灵秀湖北·四季村晚”是湖北省文化和旅游厅近年来持续打造的助力乡村振兴文化活动品牌，以村民自编自演节目为主，叠加“文旅农商”融合消费场景和“戏曲进乡村”“文化进万家”“文艺轻骑兵”等文化惠民活动，广受基层群众喜爱，2022年荣获全国最受喜爱“村晚”品牌。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）